Parece ser que no está demasiado claro porque se producen estás agujetas. Tras varias, teorías la que parece más aceptada, es la que explica que se producen micro-roturas en las fibras musculares con la formación de otras nuevas.
A día de hoy es prácticamente imposible "quitar" las agujetas, por lo que más vale un buen calentamiento previo con estiramientos y para después del esfuerzo un buen batido para combatir las agujetas...